番茄丝核菌果腐病各地均有零星发生，有时为害较重。

为害果实，一般多是植株下部接近地面成熟果实发病。多在果实肩部或脐部光发病，初时产生水浸状淡色斑，扩展后病斑大小、形状不等，褐色，略凹陷。后期病斑中心常裂开，湿度大时病斑表面有褐色蛛丝状霉。

病菌以菌丝体或菌核在土壤中越冬。病菌通过雨水、灌溉水传播。在条件适宜情况下，菌丝可直接侵染引起发病。病菌对环境条件要求不严格，13—42℃均可生长，耐干喜湿。

田间高温、高湿发病重。

(1)农业防治：高畦覆地膜栽培。密度适宜。适时整枝、搭架，改善株间通风透光条件。施足类肥、适时、适量追肥。适当控制灌水，切忌大水漫灌，雨后及时排出田间积水。近地面果实转红即应采收。发现病果及时摘除深埋或烧毁。田间病势发展应及时进行。(2)化学防治：可用20%甲基立枯磷1000倍液，或5%井冈霉素1500倍液，或50%托布津500倍液，或15%恶霉灵400倍液，或50%利得800倍液，或60%多福500倍液。