杧小果普瘿蚊主要在芒果花果期为害，以幼虫蛀食嫩叶，造成褐斑、穿孔破裂、叶片卷曲，严重时叶片枯 萎脱落以致梢枯 ，致树冠生长不良。为害高峰期植株和新梢被害率均达100％。

目前没有防治杧小果普瘿蚊的特效药物，由于化学药剂很难渗透进蛹、幼果体内，毒杀虫蛹、幼虫效果不理想；针对这些特点，该虫必须进行综合性防控，注意使用有强渗透性药剂来防治，当前主要防控要点如下：盛花期时不宜用药，末花期可使用复配的高氯噻虫嗪、高氯甲维盐等药剂喷雾树冠1～2次，每次间隔7～10天；同时可用80%敌敌畏乳油、啶虫脒、吡虫啉、阿维菌素等药物喷洒表土。

成虫适宜潮湿气候，喜欢荫蔽环境，怕强光照射。成虫寿命短，雄虫交尾后次晨开始死亡，少数在第3天死亡。成虫体小纤弱，雨天不利于飞翔活动，遇大风雨时将被打落死亡。成虫有弱趋光性，但怕强光，故晴天成虫大多躲在树冠的荫蔽处。幼虫孵化时间主要在下午。