菌核病是苦瓜的一种真菌性病害。

主要为害果实和茎蔓。(1)花。残花先被侵染，呈水浸状，后长出白色菌丝。(2)茎蔓。发病时，初在病部产生褐色水浸状斑，后长出菌丝，病部以上叶，蔓萎凋枯死。

病原菌核遗留在土中或混杂在种子中越冬或越夏。菌核萌发后通过空气传播，从花和衰老叶片侵入。病原以分生孢子和健株接触进行再侵染。

低温，湿度大，早春或晚秋多雨，利于发病和流行。连年种植葫芦科、茄科及十字花科蔬菜的田块，排水不良的低洼地或偏施氮肥或霜害，发病重。

(1)种子消毒。用50℃的温水浸种10分钟，杀死菌核。(2)农业防治。实行轮作，最好是水旱轮作。也可以在夏季，把病田灌水浸泡半个月。收获后，要及时深翻20cm，将菌核埋入土壤深层，可以抑制子囊盘出土。(3)化学防治。定植前每公顷用20%甲基立枯磷7.5kg，配成药土，耙入土中。棚室栽培，每公顷用15%腐霉利烟剂，或45%百菌清烟剂3750g，烟熏一夜，隔8～10天喷1次；或者每公顷喷撒5%百菌清粉尘剂15kg。在盛花期喷50%腐霉利可湿性粉剂 1 500倍液，或50%扑海因或50%农利灵可湿性粉剂 1 000倍液，或60%防霉宝超微粉600倍液，或20%甲基立枯磷乳油 1 000倍液，或50%扑海因可湿性粉剂 1 500倍液加70%甲基托布津可湿性粉剂 1 000倍液，隔8～9天喷1次，连续3～4次。