褐色蒂腐病在果实贮藏期极为普遍发生，是由柑橘树脂病菌侵染成熟果实引起的病害。发病多在果蒂部位开始，初呈水渍状腐烂，圆形斑，黄褐色，并逐渐向果肩、果腰扩展，与黑色蒂腐病很相似。后变为褐色至深褐色，病部果皮革质，有韧性，手指轻压不易破裂，通常无黏液流出。病斑边缘呈波纹状，深褐色。在向脐部扩展中，果心腐烂较果皮快，当果皮变色扩大至果面的1/3-1/2时，果心已全部腐烂，故称“穿心烂”，最后全果腐烂。在病部表面，有时生长白色菌丝体，并散生黑色小粒(分生孢子器)。

(1)农业防治：加强栽培管理，增强树势，并做好防寒、防晒等。

(2)化学防治：可用25%吡唑醚菌酯悬浮剂2000倍，43%戊唑醇悬浮剂3500倍、25%吡唑醚菌酯悬浮剂2000倍，12.5%氟环唑悬浮剂2000倍液等。

柑橘褐色蒂腐病以菌丝体和分生孢子器在病枯枝、病树干及死树皮上越冬，病部上的分生孢子器为次年病害的初侵染源。由风雨和昆虫传播。当果蒂形成离层的时候，病菌从蒂中部的维管束侵入或从果柄的剪口侵入，贮藏运输期间的病果，是来自田间已被侵染的果实。高温高湿条件下，发病快且严重。该病发生的最适温度为27-28℃，在20℃以下或35℃以上，腐烂较慢，在58℃时不易腐烂。