菌核病是番茄的一种普通病害。部分老菜区棚室中发生。零星发生，引起植物坏死，引起烂果，对产量有明显影响。

番茄叶片、果实和茎等部位均受害。(1)叶部。叶片染病始于叶缘，呈水浸状，淡绿色，湿度大时长出少量白霉，病斑呈灰褐色，蔓延速度较快，导致叶片枯死。(2)茎部。茎染病多由叶柄基部侵入，病斑灰白色稍凹陷，后期表皮纵裂，边缘水渍状，病斑长达株高的五分之四。除在茎表面形成菌核外，剥开茎部，可发现大量菌核，严重时植株枯死。(3)果实。果实及果柄染病，始于果柄，并向果面蔓延，未成熟果实似水烫过。

病原以菌核在土中或混在种子中越冬或越夏，是该病的初侵染源。菌核干燥条件下，存活4～11年，水田经1个月腐烂。菌核遇有适宜条件萌发，借风雨随种苗或病残体传播。病原首先侵入衰老叶和尚未脱落的花瓣，发病组织腐烂，再侵染由病健部接触传染。

(1)发病时期。北方菌核多在3～5月萌发；南方则有2个时期：即2～4月和10～12月。(2)气候因素。当气温在20℃左右，相对湿度在85%以上时，发病严重。多雨季节易发病流行。(3)栽培因素。病地连作，地势低洼，排水不良，偏施氮肥，发病重。

(1)农业防治。与禾本科作物实行3～5年轮作。深翻土地，使菌核不能萌发；未发病的温室或大棚忌用病区培育的幼苗。及时清除田间杂草。覆盖地膜可以抑制菌核萌发及子囊盘出土。发现子囊盘出土，及时铲除，集中消毁。注意通风排湿，减少传播。(2)化学防治：保护地栽培，在发病初期每公顷用10%腐霉利烟剂3750～4500g熏一夜，或喷撒5%百菌清粉尘剂 15kg，隔7～9天喷撒1次。露地栽培，在发病初期喷50%农利灵水分散剂 1 500～2 000倍，或50%翠贝水分散剂 2 500～3 000倍，或43%好力克悬浮剂 3 000～3 500倍，或53.8%可杀得 水分散剂 00～800倍，或50%速克灵可湿性粉剂 1 000倍。40%菌核净可湿性粉剂 500倍液，或65%甲硫?霉威可湿性粉剂 500～800倍液，或50%腐霉利可湿性粉剂 1 500～2 000倍液，或80%多菌灵可湿性粉剂 600倍液，隔7～10天喷1次，连续3～4次。