主要为害果实和花萼，病斑初呈水湿状，渐变为红褐色、紫褐色直至黑褐色，单个病斑圆形至椭圆形，直径2～5mm，后期多斑融合成不规则疮痂状，粗糙，严重的龟裂，直径10～30mm或更大。湿度大时，病斑内产生淡红色粉状物，即病原菌的分生孢子盘和分生孢子。

先侵染石榴枝干 ,然后侵染果实。

病菌以菌丝体在病组织中越冬，春季气温高于15℃，多雨湿度大，病部产生分生孢子，借风雨或昆虫传播，经几天潜育又形成新病斑，又产生分生孢子进行再侵染。气温高于25℃病害趋于停滞，秋季阴雨连绵病害还会发生或流行。

(1)休眠期防治。于4月上旬，用小刀刮除病斑，然后用35%百菌敌5倍液涂刷病斑，涂刷量以微下流液为度，用此法防治病斑，治愈率可达90%左右。结合冬季修剪，剪除病枝、病果，刮除病疤，清理果园中的枯枝落叶，集中销毁或深埋。(2)花后和果实膨大期防治。6～7月正是石榴疮痂病的盛发期，可分别在6月中旬、下旬和7月上旬，定期用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液均匀喷撒果面，用此法防治果实，防效可达88%以上。(3)农业技术措施防治。加强肥水管理，增强树势，提高树体抗病能力，选用抗病品种。(4)刮治方法。一是刮治病疤皮层。用小刀把病疤皮层全部刮下，并向四周刮出新的皮层，刮完后，立即涂药消毒，已利形成愈伤组织，并将挂下的病疤组织受在塑料袋内，集中销毁，以防病菌蔓延。二是保留病疤皮层。此法不需将病疤皮层刮下，而是用小刀在病疤处纵划病斑2-3道，划时上、下要直，深达木质部，四周要刮到新的皮层部，然后涂抹药剂消毒。用这2种不同的刮除病疤法防治石榴疮痂病，并把治愈率均达80%以上。