病原与黄瓜炭疽病相同，发病特点亦基本相同。所不同的是：由于冬瓜果实皮厚并有蜡粉保护，可能对炭疽病侵入不利，果实炭疽病基本不会发生。

为害子叶、真叶、叶柄、主蔓、果实等部位。以果实症状最为明显，为害性也大。(1)果实。发病时在顶部出现水浸状小点，扩大后出现圆形褐色凹陷病斑，湿度大时病斑中部长出粉红色粒状物。病斑连片致皮下果肉变褐，严重时腐烂。(2)叶片。病斑为圆形，直径3～30mm，褐色或红褐色，周围有黄色晕圈，中央色淡，病斑多时叶片干枯。

病原以菌丝体，拟菌核在种子上或随病残株在田间越冬，也可以在温室或塑料大棚旧木料上存活，成为初侵染源。带病种子可引起幼苗发病。病原通过雨水传播。

温度在10～30℃范围内均可发病，24℃时发病最重。适温范围内，空气湿度大，易发病。

(1)种子消毒。用50～55℃的温水，浸种20分钟。或用冰醋酸100倍液浸30分钟后，用清水冲洗干净后催芽。(2)农业防治。实行3年以上轮作。苗床用无病土或进行苗床土壤消毒，地膜覆盖栽培，增施磷钾肥。棚室栽培，要注意通风排湿，使棚内的湿度控制在70%以下，减少叶面结露和吐水。(3)化学防治。发病初期开始喷施25%阿米西达悬浮剂 833～1250倍液，36%甲基托布津悬浮剂 500倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂 1 500倍液，或80%炭疽福美可湿性粉剂 800倍液，或25%溴菌清可湿性粉剂 500倍液，连续施药3次，每次间隔7天。棚温栽培，在发病初期，每公顷用45%百菌清烟剂3750g，烟熏防治，隔9～11天烟熏1次。或者于傍晚，每公顷喷撒6.5%甲霉灵超细粉尘剂或8%克炭疽粉尘剂15kg。